Não importa se você conecta dois ou mais computadores em uma rede, você tem de se preparara para certas questões. Como você mantem a informação pessoal privada? Como você protege o sistema de hackers maliciosos? Como você controla quem acessa o sistema e usa os recursos? Como você assegura que o usuário não consome todos os recursos do sistema?
A resposta curta a essas questões é middleware. Não há nada inerente no sistema de computação em grade que possa responder a essas questões. Os protocolos emergentes para o sistema em grade são desenhadas para tornar mais fácil aos desenvolvedores criar aplicações e facilitar a comunicação entre computadores.
A técnica mais comum que os engenheiros da comptuação usam para proteger dados é a criptogrfia. Criptografar dados é codificá-lo de modo que apenas alguém que possua a chave apropriada pode decodificar os dados e acessá-los. ironicamente, um hacker poderia, de modo concebível, criar um sistema de computação em grade com o propósito de quebrar a informação codificada. Porque o uso de técnicas de criptografia torna a codificação dos dados complexa, um computador normal levaria anos para quebrar o código (que normalmente envolve encontrar os dois maiores divisores primos de um número incrivelmente grande) costumam complicar a codificação. Com um sistema de computação em grade poderoso o suficiente, um hacker poderia encontrar uma maneira de reduzir o tempo que leva para decifrar os dados criptografados.
É difícil proteger um sistema de hackers, principalmente se o sistema se baseia em padrões abertos. Cada computador em um sistema em grade tem que ter determinados softwares para ser capaz de se conectar e interagir com o sistema como um todo - computadores não sabem como fazer sozinhos. Se o software do sistema do computador for proprietário, seria mais difícil ainda (mas não impossível) para um hacker acessar o sistema.
Na maioria dos sistemas de computação em grade, apenas certos usuários estão autorizados a acessar todas os recursos da rede. Do contrário, o nó de controle seria inundado com requisições de preocessamento e nada aconteceria (uma situação chamada deadlock, ou sobrecarga, no mundo da TI).Também é importante limitar o acesso por questão de segurança. Por essa razão, a maioria dos sistemas tem protocolos de autorização e autenticação. Esses protocolos limitam o acesso à rede a um número seleto de usuários. Outros usuários ainda são capazes de acessar suas próprias máquinas, mas eles não podem tirar proveito de toda a rede.
O middleware e o nó de controle de um sistema de computação em grade são esponsáveis por manter o sistema rodando sem problemas. Juntos eles controlam quanto acesso aos recursos da rede cada computador tem e vice-versa. Embora seja importante não permitir que um computador domine a rede, é tão importante quanto não deixar que aplicações da rede consumam todos os recursos de um computador. Se o sistema rouba do usuário os recursos de computação, então não é um sitema efiiente.